方仁诊断后，发现这就是急性阑尾炎，需要手术治疗。
没想到这个治疗方案，立刻就捅了马蜂窝。其他名医根本就不信这种治疗办法，并且从学术之争，上升到了人身攻击。他们认为方仁很有问题，如果不偷盗尸体解剖，又怎么知道人体的结构呢？
而那位将军的部下们同样气急败坏。东汉讲究的是孝道——身体发肤受之父母，不敢毁伤，孝之始也！
连头发都不能损伤，哪里来的傻大胆，还想要割断将军的一段肠子？
突然之间，方仁的人身安全就受到了威胁。卢植同样将信将疑，就把方仁暂时关押起来。
刘关张立刻出面求情，但他们人微言轻，根本在卢植面前说不上话。范桥同样求到孙坚跟前，孙坚也向卢植求情，于是卢植就给了一个机会，寻找到了一个普通老百姓的病例，让方仁试着动个手术。
没想到手术很成功，伤口却恶化了。那是细菌感染，目前并没有很好的特效药。方仁的处境立刻变得岌岌可危。为了治疗伤口恶化，方仁就提出了新的治疗方案，清理伤口的腐肉脓血，直接用高度白酒茅台消毒。
在一番抢救后，方仁总算救回了患者的性命。但结果却很无奈，谁也不敢信任他，不敢让他对那将军进行手术。
幸好此时华佗赶到。他并没有什么门户之见，反而主动与方仁交流，并且在讨论后，最终出面担保了方仁的手术。卢植他们最终被勉强说服，再次给了方仁机会。
这回准备就充分了许多。有了华佗的麻沸散，还有术后的茅台消毒，那位将军很快就恢复健康。
并且这样新奇的治疗方法，让所有人都对方仁惊为天人，一下子就有了神医的美名。
华佗同样对方仁的医术很好奇，俩人就不断的借鉴讨论，使得华佗心痒不已。他就有了决定，留在方仁身边，继续学习那些来自现代的先进医术。
就是方仁身边的东西，用的已经差不多。现在他只剩下一瓶茅台，还有一支抗生素。如果全部用完后，对许多病真的就束手无策了。
而大军也包围了黄巾军主力，开始了最终围剿。
由于卢植对汉灵帝很愚忠，他万分痛恨那些祸乱天下的乱臣贼子。作为大军统帅，他就下令不留俘虏，斩尽杀绝！
黄巾军的余孽被包围在黄河边上，里面有许多的老幼妇孺。朝廷大军开始了大屠杀，方仁却忍受不住这样的惨剧。他主动拦到大军跟前，想要阻止这场屠杀，并且向卢植和其他将军求情，留给这些人一条活路。
刘关张勒住了战马，孙坚同样阻止了江东军的战斗……，越来越多的将士停下脚步，最终让卢植长叹一声“罢了，收俘吧！”
然而令人震撼的一幕出现了。黄巾军的主帅带着一群父老，惨笑着向方仁叩拜感谢，接着高唱“苍天已死黄天当立！”毅然决然的转身跳河自尽。
随着这个举动，所有的黄巾军都是齐声高唱，带着彻底的绝望，他们全部跳入滚滚波涛之中。没一会儿，河面飘满了那些人的尸体……
“何至于此？何至于此？”方仁流着泪高喊。他垂头顿足，内心是相当的失望。
而卢植这些将士也同样沉默不语。这样的大胜又有什么可夸耀的呢？
黄巾之乱虽然得到平息，但天下大乱很快就要降临了……
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